Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Alg13Q9D8C3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Alg13Q9D8C3 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms