Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chmp4bQ9D8B3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chmp4bQ9D8B3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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