Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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