Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bcl11bQ99PV8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms