Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms