Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms