Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ccdc17Q8CE13 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ccdc17Q8CE13 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc17Q8CE13 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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