Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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