Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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