Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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