Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms