Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rmi2Q3UPE3 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms