Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms