Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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