Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms