Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PrcdQ00LT2 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms