Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcr4P70658 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms