Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tra2bP62996 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms