Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms