Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms