Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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