Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprkP35822 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprkP35822 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms