Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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