Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RarbP22605 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RarbP22605 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RarbP22605 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RarbP22605 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RarbP22605 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RarbP22605 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RarbP22605 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RarbP22605 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RarbP22605 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RarbP22605 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RarbP22605 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RarbP22605 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RarbP22605 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RarbP22605 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms