Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms