Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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