Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Taf4E9QAP7 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms