Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt78E9Q0F0 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms