Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Serpina10-202ENSMUST00000121625 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Igkv3-11-201ENSMUST00000197500 385 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ccl19-201ENSMUST00000102957 745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Taz-213ENSMUST00000135504 747 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 Mir5114-201ENSMUST00000175574 61 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 Gm28676-201ENSMUST00000188990 591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NhsB1AV60 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms