Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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