Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lgr5Q9Z1P4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms