Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Col5a3Q9JLI2 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Col5a3Q9JLI2 Mrgpra2b-201ENSMUST00000119798 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Col5a3Q9JLI2 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Col5a3Q9JLI2 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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