Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccdc97Q9DBT3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms