Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nop56Q9D6Z1 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nop56Q9D6Z1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nop56Q9D6Z1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nop56Q9D6Z1 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nop56Q9D6Z1 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nop56Q9D6Z1 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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