Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hecw1Q8K4P8 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hecw1Q8K4P8 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hecw1Q8K4P8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms