Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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