Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp27Q8CEG8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms