Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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