Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms