Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms