Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssx9Q6XAS3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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