Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms