Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5460Q3UQ97 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms