Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms