Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms