Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rpusd2Q149F1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpusd2Q149F1 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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