Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah1bQ06985 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms