Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms