Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms