Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms